- Lugia y Ho-Oh: No hace falta ser un lince para caer en que estos dos Pokémon legendarios serán capturables en las Ediciones Plata Alma y Oro Corazón. Ambos legendarios salen en ambas ediciones, pero el que corresponde al juego en concreto saldrá tras derrotar al Team Rocket mientras que el otro más tarde en el juego. Lugia se encontrará como siempre en Islas Remolino, y Ho-Oh aguarda a renacer de sus cenizas en la Torre Hojalata, en ambos casos al nivel 45.
Raikou, Suicune y Entei: Raikou, Suicune y Entei estarán accesibles una vez derrotes a la Liga Pokémon, y aparecerán correteando libres por Johto al nivel 40. Eusine, el personaje exclusivo de Pokémon Cristal, estará relacionado con esta trama, y te ayudará a capturar a Suicune.
Gyarados Rojo: Gyarados aparece de color rojo brillante en su versión shiny al igual que lo hacía en Oro y Plata originales. Sale en Lago de la Furia al nivel 30.
Kyogre, Groudon y Rayquaza: Estos legendarios estarán accesibles una vez derrotes a la Liga Pokémon. Groudon será exclusivo de la Edición Plata Alma mientras que Kyogre será exclusivo de la Edición Oro Corazón. Es posible que debas capturarlos mientras corretean libres en estado salvaje. Una vez tengas ambos Kyogre y Groudon en el juego, Rayquaza aparecerá para que lo captures. Todos estos Pokémon aparecen en una cueva secreta al nivel 50 una vez superes la Liga Pokémon.
- Palkia, Dialga y Giratina: Los legendarios Dialga, Palkia y Giratina también estarán disponibles en las Ediciones Plata Alma y Oro Corazón. Para ello deberás traerte al Arceus promocional desde las Ediciones Diamante, Perla y Platino. Podrás elegir uno de estos tres Pokémon, que nacerán al nivel 1 con un movimiento especial
- Mewtwo: El misterioso legendario Mewtwo podría aparecer en las Ediciones Plata Alma y Oro Corazón. No es un dato confirmado, pero su inclusión en la lista de Ubers permitidos en el Campeonato Pokémon 2010 junto a los restantes Pokémon legendarios de estas ediciones parece indicarlo.
